初生历158年,地球上约9999%的物种从大地上消失,总人口锐减到三千万,相当于战前一个城市的人口总数。幸存者中出现了拥有珍贵「记忆」的人类munin(雾尼),其中的特殊人类hugin(夫金)掌握着“已逝的文明”,因其代表「思维」而被人们尊称为“路引”,意为通往真理的钥匙。人们在残破的世界中活了下来,但神明的惩罚似乎并未结束,越来越多的人因为不明原因而陷入无法控制的疯狂…… 少年琉月,唯一进入过「真理之门」的人,堪称天选之人。从小被中央政府当做「新王」培养,后被舍弃。十年间,他以普通人身份就读于中央第三学院,在毕业前夕收到收养人的书信前往公共区时,被迫卷入到一场奇怪的战斗中。lead x soldier名为夺取「记忆」的战斗正式拉开序幕……