池田恒兴看着那些信徒如浪潮一般，前赴后继地冲向他的部队。虽然大多数的人都毫无意义地被杀死，但是还是有少部分人能够冲到织田军身前，用自己所有的攻击手段去击打织田家，武器掉了就拳打脚踢，手脚被砍断了就用牙咬，还有疯狂的人用头去撞战兵坚硬的具足。尸体在战线前越堆越高，织田军正艰难地推进着。
2月20日，织田家终于磨到了石山城的城墙下，开始试图填平石山城下的护城河。然而，石山城内拥有的铁炮数量远远超乎了织田信长的想象，给织田军带来了重大伤亡。赤母衣众的笔头——织田信长的亲信塙直政，在前线指挥部队时被当场射杀。粗略估计下，城内的铁炮就要有五六千吧。这显然不是进城的杂贺众、根来众佣兵所能带来的，本愿寺自己肯定也在这几年里购买了大量铁炮。
塙直政的意外阵亡让织田信长暴跳如雷，他立刻催动全军进行猛攻。雨秋平本想故技重施，用他那简单粗暴的慢吞吞破城法来打下南门，却被织田信长痛骂一顿后给撤下了前线，安排了一大批勇猛善战的武士率军攻城。
然而，一向宗信徒的狂热和顽强远超织田军的想象。他们在城头用血肉之躯抵达织田家的进攻，时常有重伤的一向宗信徒不管不顾地抱着织田家的士兵跳下城去同归于尽，战况十分惨烈。
不过，织田信长这次似乎铁了心要把石山御坊给打下来了，对石山御坊的各个城砦和城墙段发动了孤注一掷的猛攻。在织田军的狂攻下，本愿寺眼看着要陷入颓势，一座座城砦被拔除，城头也被织田家反复攻占。虽然到了夜晚，本愿寺家就会对城墙上的织田家进行猛攻，把织田家给打下城去。可是到了第二天，卷土重来的织田家也会把这一段城墙给抢下来。织田家甚至开始破坏城垛，以便于己方第二天的攻城行为。
然而，就在这关键的时刻，海上却传来了糟糕的消息——本愿寺家的援军到了。不是别人，正是毛利水军和三好水军的联军，浩浩荡荡一千四百多艘船只在淡路附近回合后，就朝着石山御坊开来。九鬼嘉隆的两百余艘小船在三好家庞大的舰队面前，弱小的就仿佛大象面前的蚂蚁一样。然而，这一次九鬼嘉隆可没办法避战了，因为织田信长给他下了死命令——顶住！
织田信长此刻已经杀红了眼，眼看着坚如磐石的石山城终于被他啃下了一块肉，让他现在收兵离开实在是无法接受。他想要九鬼嘉隆顶住三好家和毛利家的水军几天，为他夺下石山城创造机会。只要石山城拿下了，那么三好家和毛利家的水军再强也拿这座坚城无可奈何。
不过，援军的抵达显然鼓舞了本愿寺家的士气，他们抵抗得更为顽强，织田家在数千把铁炮接连不断的射击下死伤惨重。而九鬼嘉隆在三好-毛利联军面前，居然连一天都没撑住，几乎寸板不回。
随着三好-毛利联军在石山城西边的滩涂登陆，本愿寺立刻打开西城门迎接援军入城。三好-毛利援军携带着数目更加客观的铁炮入城，生力军的抵达给了筋疲力尽的织田军当头一击，被直接赶出城去。
织田家连续强攻半个月，士气已经损耗殆尽，众人都劝织田信长趁早退军。可是织田信长此刻已经下不来台，不愿意轻易认输，而是再次发动了一次全线猛攻。然而，此刻石山城内，联军拥有的铁炮数量将近上万。强劲的火力配上石山城的铜墙铁壁，织田家的最后一次进攻付出了无比惨重的伤亡。而与此同时，位于丹波和丹后的波多野家和一色家也再次起兵，意图进攻若狭和京都，织田信长不得不黯然退兵。
这一仗，使得近来势头正旺的织田家不得不重新冷静下来考虑自己的战略。这一次织田信长对本愿寺的进攻，颇有些大意轻敌。似乎觉