崇祯六年，帝纳周氏姐妹为妃，同年，丁皇后诞下公主，赐号长平。次年，周氏姐妹诞下一子一女。
崇祯九年，魏忠贤病逝，皇帝追封其为忠国公，谥号“忠义”。王崇恩继任大明税务总督职位。
同年，裴纶升任锦衣卫指挥使，南镇抚司改组监察院，监察厂卫法纪，沈炼为第一人检察院都指挥史。
十月，毛文龙率部下耿忠明叛明降清，帝大怒，召满朝文武廷议攻打金人事宜，百官纷纷反对，帝无奈作罢。
十一月，叛将毛文龙自朝鲜海路攻入关内，以尚可喜为内应，攻陷登州，虎视莱州；而皇太极又亲自统领八旗军十万，避开宁远、锦州，分兵三路从龙井关、洪山口、大安口突入关内，攻占遵化，京师告急，大明烽烟再起！
帝震怒，下决心要把皇太极留在关内。
帝以京城为饵，竖壁清野，诱敌深入，令辽东、宣府、及冀州三处呈合围之势，断八旗军后路，又以新军统领京城防护。
莱登方面，帝命孙传庭入山东，又派韩旷、卢剑星前往朝鲜行合纵之事，令卢象升出陕入鲁，和孙传庭兵合一处。
这是崇祯朝最大的一场战役，这场战役，一战奠定了大明中兴的基础，也奠定了崇祯大帝的不朽之名！
皇太极在京城下遭遇了火炮、炸药等新军火器残酷摧残，丢下三万尸体，仓皇而逃，孙承宗、史可法等将领得皇帝吩咐，稳扎稳打，步步合围，将皇太极困于空城遵化，围而不打。
崇祯十年三月，皇太极被饥困绝望的蒙古兵所杀，金人开城投降，帝不允，四万之众，皆坑之。
满朝欢腾！
与此同时，毛文龙败退朝鲜，败朝鲜官兵，割城而据。
崇祯皇帝的威望，到达了前所未有的巅峰！
三月二十七，皇太极之子毫格继位，多尔衮摄政，统领金人兵马大权。
四月初一，帝以孙承宗为帅，以史可法为副将，出山海关，反攻金人。五月十三，史可法以炸药、火炮克辽阳，金人死伤无算！
五月二十，分兵抚顺，以蒙古各部为内应，攻克抚顺，袁崇焕屠城三日，被御史弹劾，帝命其戴罪立功。
五月二十七，大明合围沈阳。
绝望的金人，爆发了惊人战力！
这一战，尽管大明有火器之利，但仍死伤两万有余，金人五万人马全军覆没，多尔衮与皇宫中杀后宫嫔妃及皇子公主，举火而死，皇子毫格不知所踪。
金朝自此正式灭亡！
割据朝鲜的毛文龙很快向皇帝求罪乞降，帝命卢象升、孙传庭格杀勿论。遂此二部和李氏朝鲜军合围，彻底歼灭毛文龙所部，毛文龙、耿忠明被部下所擒，尚可喜战死军中。
崇祯十年六月十六，毛文龙、范文程等明奸被押赴京城，于菜市口凌迟处死，数万百姓观刑，无不争啖其肉，争饮其血。
崇祯十一年，大明开海事局，分别以史可法、郑芝龙、李定国为将，分三个舰队，远征海路。
崇祯十四年，郑芝龙于葡国海战中战死，帝赐其子郑森爵位，追封郑芝龙为忠勇伯。同年，史可法、李定国满载而归。
大明真的发达了，海路贸易的繁荣，彻底夯实了大明中兴的基础，源源不绝的财富自海上而来，使得国内灾祸带来的损失得到极大程度的弥补和缓解。
崇祯十七年，帝迁都南京，同年，万邦来朝！
崇祯大帝在位三十二年后，大明已彻底变成了一个资本主义开始蓬勃发展的帝国，自崇祯十七年始，皇太子朱慈恒