光阴流逝，人也变得面目全非。
也是因为这个，他们才彻底看清楚，一直以来引以为傲的三代与日斩团藏一明一暗，两者平衡调控木叶管理的想法，是多么天真且脆弱。
的确，理论上是行得通的，一代二代就是这样把木叶的架子支起来，但别忘了，一代二代有着非常紧密的亲缘关系，而且二代也信服自家大哥的实力。
三代猿飞日斩跟志村团藏之间的关系却脆弱得很，加上三代没有初代那样的震慑力，他亲和稳健的处事方式并不为志村团藏所认可。所以，当黑暗再也不满足与光明平分半边天，想要吞噬光明的时候，平衡就会被破坏掉。
根忍原来是培养来处理木叶一些不好放到台面上弄的东西，但志村团藏却把他们打造成为他的一支军队，以他的命令作为最高指令，只要不是傻子都知道这意味着什么。
三代察觉到他的恶念，才勒令根忍组织不论如何发展都要控制在一定规模，而且逐年稳定下雄厚实力的火影直属暗部和正规军都让志村团藏颇为忌惮，才控制着没有伸手。
唯一值得庆幸的是，志村团藏确实与六年前的九尾事件没有关系，但坏就坏在，他针对宇智波一族的事不是出于对村子的利益考虑，而是因为他从友人宇智波镜留给他的写轮眼研究中发现其巨大的潜力，引生贪婪之心，想把这一族人逼迫造反，好把这些眼睛都拿到手，增强自身的实力。
反正宇智波一族在他看来早已钉上反叛的标记，后来也确实查获实证，所以他无论做什么事都是合情合理的，反而三代处处容忍的态度才最让他气极。
觊觎万花筒写轮眼功用，袭击宇智波止水，更是把他那狰狞面孔清清楚楚地映在止水那双眸子里，让顾问们看清楚他们好友那不为人知的险恶一面。
最致命的一点就是在志村团藏身上发现了木遁细胞，目前医疗部对木遁的研究还处于一个非常基础的分析水平，然而志村团藏身上的木遁细胞却展现出一个非常成熟的技术高度，这便意味着他把细胞植入身体的技术绝对不可能是木叶自己人所为。
而是很可能与之有联系的，某个已经远离木叶，却依旧还在影响着木叶运行的男人的杰作。
自那以后，明显受打击而神情黯淡的两位顾问老人再也没有对审查工作干涉过。
只是，艰苦的工作这才刚刚开了头。
志村团藏的“根”埋藏极深，他培养的根忍规模也早已远远超出了三代给他的范围，除却已经登记在册，还有接近两百人没有人物信息记录的。
三代在了解情况后，很迅速就下达了指令：“不能把咒术解了，要是那些知道木叶情报的根忍趁此机会脱逃，木叶会陷入麻烦的，必须立即改写禁咒启动方式，严密审查村内根忍的思想情况，有问题的一律清洗记忆再教育，没问题的打乱编入正规军。”
由此，拷问部、情报部、医疗组织等等木叶的所有部门都开始高速运转了，换句话就是大家都忙成狗了，天天加班加班加班，空闲点的暗部都被抓壮丁了。
尽管如此，恐怕还是力有不逮。
根忍对志村团藏的忠心度令人骇然，就在志村团藏被关押起来没多久，一部分的根忍就自发组织起来入侵秘密关押所，不过鉴于这一段时间的训练，暗部组织防御的时间非常快，就在他们刚动手没多久，就被暗部们和附近赶来的正规军上忍们制服了。