除开规模大之外，科学院这些工厂赚钱的速度也堪称一流，光是自行车和三轮车，在三省六部的官员和平民百姓看来完全就和抢钱差不多，用日进斗金都无法形容。
赚钱多自然令人眼红，但科学院赚的钱既不纳税也不交公，全部都内部消化了。
虽然科学院各种研发耗费大量的资金，科学院其实也没多少余粮，但在外人看来可不是这样。
世人从来只见小偷吃肉，看不见小偷挨打。
因此许多人都对科学院明里暗里极度和不满，甚至是非议，认为少府每年投资这么多钱，浪费这么多钱财粮食在科学院，但赚的钱都内部私分了。
这种说法并不隐晦，实际上很多人当着科学院官吏工匠的面都说。但只有科学院内部人员才知道，工资待遇的确不错，但尼玛也一天天累的像狗一样，私分钱财这种事更不可能，有些研究甚至还要自己掏钱才能支持下去。
面对外界的猜测和非议，面对科学臃肿不堪的体积，陈旭这次也终于决定拿科学院开刀，彻底完成产研分离的改制，将乱七八糟的操心事都丢给朝廷去管，以后科学院要研究，直接伸手向朝廷要钱，有了财政署和工部官员的监督审计，他们自然也就知道科学院到底挣不挣钱有没有私分财产了。
对于陈旭改组科学院的奏书，意见并不统一，始皇帝和少府官员认为目前科学院发展很好，一切都由陈旭自己说了算，没人监督干预是最好的现状，但三省六部还是有许多官员认可陈旭的说法，科学院太大太乱，的确需要改制，这些以财政署和工部户部为主，至于吏部刑部兵部的官员，基本不开口，即便是开口，他们说了也不算。
朝堂一阵吵吵嚷嚷之后，始皇帝最后还是在陈旭的坚持下同意这份改制奏书，但强调无论是少府还是工部户部，以后对于科学院的发展和投入只能加大，不能减少。
作为不偏不倚的帝王，始皇帝自然能够看得出来科学院无与伦比的重要性，任何一项研究成果，都足以改变大秦的现状，光是钢铁、水泥、织机这三项，就堪称划时代的研究发明。
第三份奏书，陈旭提请成立科学院下属的技工学校，面向全国郡县招收头脑灵活的年轻人，每个郡每年都安排一定的招生名额，开始为大秦培养正规而全面的职业技术工人。
这份法案并不算离奇，本来大秦继承商周遗传下来的各种敬天法祖自然合一的理念，对于伐木开荒打猎都有一些法令方面的要求，比如二月到七月生长季节，不许砍树，不许烧荒，不准采集刚发芽的植物，还有不许猎杀怀孕的母兽和幼兽等等。
蒸汽机的研究虽然远没有达到商用的阶段，但这种简单的动力必须研发成功，而且也肯定会成功，这几年的研究已经有了不小的进步，蒸汽推动活塞往复运动的气密性试验已经成功，至少在精密程度上已经达到了进一步研究的地步，而且研究方向也很清晰，最多一年时间，陈旭相信研究所能够拿出比较成熟的原型试验机，只要蒸汽机研发成功，蒸汽火车和轮船也就可以提上研发日程，十年之内，大秦必然能够诞生火车和轮船……
第四份奏书，陈旭提请成立农业科学院，将农学院改制为农业大学。
农学院成立七八年，对于各种农具的改良、农作物的栽培和畜牧养殖等都积累了大量的经验，编著整理了大量的农科书籍，也培养了大量的农业技术人才，这些年对于大秦的农业发展做出了不可磨灭的贡献。
不过随着农业的不断发展