另外一种说法则倾向于零号机作为原初机体，因此有各种各样的缺陷，原型机本身问题很大。这个说法的依据是来自二号机，二号机本身其实也是很独特的，其中比较奇怪的一点就是明日香感觉到自己母亲的灵魂在二号机里，但事实上明日香的母亲也是自杀，而且同样死在一个和eva完全没关系的地方。
但是如果这样说的话，有个问题就很奇怪了，假设二号机有明日香母亲的灵魂庇护，那么它应该也和初号机一样，对于外人搭乘自己产生强烈抗拒。事实上在绫波丽试图搭乘初号机的时候，就被直接抗拒了。
但事实却是，二号机一直很稳定，无论是被谁搭乘都没有出现过任何问题，明日香没问题，渚薰没问题，真希波也没问题———就连碇真嗣在最初的时候其实也和明日香一起进入过二号机的插入栓里，依旧没有引起任何问题。
只有绫波丽没有搭乘过二号机，所以无法验证最后一个假说———那就是这些机体本身其实都没毛病，只是绫波丽自己精神不稳定，因此无论她驾驶哪台eva，都很容易引起暴走和拒绝反应。
其实原本动画里是有一次绫波丽差点儿就验证这个假说的是否正确，无奈当时的明日香死也不愿意让绫波丽搭乘二号机，于是本着科学严谨的精神，最后这个可能性最高的假说，也只能够是个假说了。
如果绫波丽在搭乘“谁都可以”的二号机时也出现暴走反应的话，那么假说倒是可以被判定为证据了。
当然了，从表面上来看这个假说不太成立，毕竟绫波丽的情绪起伏不大，看起来完全不像是那种会暴走的人。但事实证明绫波丽自身并没有生存的欲望，甚至好几次有故意求死的想法，这种人哪怕性格本身没问题，潜意识里或许也会产生某些不好说的想法。
毕竟拿着n2炸弹直接冲过去自爆，而且动不动就用同归于尽的打法战斗———这怎么看都不像是那些看起来冷静的人能干的出来的。
不过现在，在亲眼目睹了零号机之后，方正也总算是判断出了零号机暴走传说的问题所在。
正如之前的假说二所猜测的一样，作为第一台真正成型的原型机，零号机从灵魂层面是存在缺陷的。
这就好像是装了ghost系统的电脑，你开机关机没问题，但是你要运行一些什么程序，说不定就会因为系统里缺少相应系统文件死机或者直接蓝屏了。
初号机显然是因为碇唯自己酱化补完系统文件解决了这个问题，至于二号机嘛………方正目前还没看到，自然也就不好说了。
而在这之后，方正也终于见到了这个世界里人气最高的人物。
“我是绫波丽，初次见面。”
平淡如雪的声音，苍白的头发与鲜红的眼眸，淡漠的面庞，看起来和方正记忆中的倒是很相似。
“你好，我是方正，你应该已经知道了，从现在开始，我就是你们驾驶员的代理监护人………当然，目前只有你一个。”
方正笑呵呵的对着绫波丽打了声招呼，对于对方的反应，他也不意外，看动画都看了全集，绫波丽什么性格，方正可是再清楚不过了。
“我可以叫你丽吗？”
“可以。”
“很好，丽，那么你应该已经知道了，葛城负责作战安排，赤木博士则是负责你的身体状况，而我的主要任务是负责你们的生活和学习………当然目前只有你一个。”
说道这里，方正又是呵呵一笑。就如同他所说的，虽然碇源堂同意